VetBact
Veterinärmedicinsk bakteriologi: information om betydelsefulla arter
Veterinärmedicinsk bakteriologi
En del bakterier kan fermentera (jäsa) glukos till en blandning av följande organiska syror: myrsyra, ättiksyra och mjölksyra. Detta kallas blandad syra-jäsning och orsakar kraftigt sänkt pH i mediet. Därför kan blandad syrajäsning påvisas genom tillsats av indikatorn metylrött (MR). Testet kallas ibland för MR-test.
Metylrött-test, där det högra röret visar en positiv reaktion. (Bild: SLU/SVA.)
Vissa medlemmar av familjen Enterobacteriaceae har blandad syrajäsning (se resp. bakteriesida), som alltså kan användas för att skilja på dessa bakterier.
Uppdaterad: 2017-12-08.
InnehållFiguren visar resultatet av ett citrattest genom stickinokulering på "Simmons citratrör" där rör A utgör negativ controll. Rör B innehåller Citrobacter freundii och rör C innehåller Escherichia coli. Observera att ett färgomslag har skett i rör B eftersom C. freundii kan växa på citrat som kolkälla.
Bild: Karl-Erik Johansson (BVF, SLU) och Lise-Lotte Fernström (BVF, SLU).
En del bakterier kan utnyttja citrat som enda kolkälla och citrattestet visar om bakterien ifråga kan göra det.
Citrat-testet används bl.a. för att skilja Citrobacter freundii från Escherichia coli.
Uppdaterad: 2018-06-06.
InnehållKan bl.a. användas för differentiering av vissa Campylobacter-arter.
Uppdaterad: 2012-12-11.
InnehållMånga bakterier har enzymer, som bryter ner nukleinsyra för att bakterien ska kunna använda de ingående nukleotiderna till att bygga upp den egna nukleinsyran. DNas är ett sådant enzym som alltså bryter ner DNA. Förekomst av DNas är karakteristiskt för vissa arter eller stammar av bakterier och används alltså för typning.
Figure: DNas-test på Staphylococcus spp. Stammen i det övre stryket är negativ (ingen uppklarning runt stryket), medan stammen i det nedre stryket är positiv. (Bild: SLU/SVA)
Man kan testa om bakterien har DNas genom att odla dem på en agarplatta, som innehåller DNA. Om bakterien har DNas och om man låter bakterierna växa över natten så kommer DNA att brytas ner och om man då häller utspädd saltsyra (HCl) på plattan, så får man en klar zon närmast kolonierna eller stryket och en utfällning på resten av plattan. Detta beror på att de enskilda nukleotiderna är lösliga i utspädd HCl, medan DNA faller ut.
Testet är användbart för att skilja:
Uppdaterad: 2017-12-08.
Innehåll
Figuren visar resultatet av ett hippurattest där rör A utgör negativ kontroll. Rör B innehåller Streptococcus agalactiae, som är hippuratpositiv och rör C innehåller Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae, som är hippuratnegativ. Observera att ett färgomslag har skett i rör B därför att S. agalactiae är hippuratpositiv. Notera även att hippuratnegativa bakterier kan ge ett svagt färgomslag.
Bild: Karl-Erik Johansson (BVF, SLU) och Lise-Lotte Fernström (BVF, SLU).
Vissa bakterier kan hydrolysera hippurat till aminosyran glycin och benzoat med hjälp av enzymet hippurikas. Glycin kan påvisas med hjälp av ninhydrin, som reagerar med fria aminogrupper (-NH2) och det bildas en blåfärgad produkt.
Hippurat-testet används framför allt för att skilja Campylobacter jejuni (hip+) från Campylobacter coli (hip-) och för att skilja på olika streptokocker (se figur). Används också i kombination med andra tester för att typa Brachyspira spp.
Uppdaterad: 2017-03-31.
Innehåll
Spot indol-test.
A. Applicering av spot indolreagens.
B. Applicering av indol-positiv bakterie.
C. Applicering av indol-negativ bakterie.
Klicka på bilden för att förstora den.
Bakterier som uttrycker enzymet tryptofanas kan hydrolysera aminosyran tryptofan till indol, pyrodruvsyra och ammoniak. Närvaro av indol kan påvisas antingen med hjälp av Kovács reagens eller med spot indol-testet. Spot indol testet innehåller p-Dimethylaminocinnamaldehyd vilket ger en turkos färgning. Kovács reagens innehåller p-dimetylamino-benzylaldehyd, som bildar ett rödfärgat komplex med indol.
Konfirmering av misstänkta E. coli-stammar. Typning (artbestämning) av Brachyspira-arter i kombination med andra tester. Kovács indolreagens är något känsligare än spot idolreagensert, men det är inte att rekomendera för anaeroba bakterierer. Spot indol kan användas får såväl anaeroba som aeroba bakterier.
Uppdaterad: 2017-12-20.
InnehållKaliumhydroxidtest.
A. Applicering av kaliumhydroxidlösning på objektglas.
B. Bakterier överförs och blandas med KOH-lösningen.
C. Resultat med gramnegativa bakterier där vätskan blir viskös och man kan se DNA-tråden.
D. Resultat med grampositiva bakterier där vätskan inte blir viskös.
Klicka på bilden för att förstora den.
Syftet med kaliumhydroxidtestet (KOH testet) är att identifiera gramnegativa bakterier. KOH löser upp det tunna peptidoglykanlagret i cellväggen hos gramnegativa bakterier, men påverkar inte cellväggen hos grampositiva bakterier. Lyseringen av cellväggen hos gramnegativa bakterier innebär att innehållet inklusive DNA frigörs. Frisläppt DNA gör lösningen viskös, fastnar på plastöglan och blir tråddragande. Cellväggen hos grampositiva bakterier påverkas inte av KOH, då de har ett tjockare peptidoglykanlager. Detta medför att cellen inte lyserar och inget DNA frigörs och lösningen blir inte viskös.
Positivt resultat: Lösningen med bakterier (gramnegativa) blir viskös
Negativt resultat: Lösningen med bakterier (grampositiva) blir inte viskös
Syftet med KOH testet är att snabbt skilja mellan gramnegativa och grampositiva bakterier som ett komplement till Gramfärgning. Testet är inte användbart för anaeroba bakterier.
Uppdaterad: 2017-12-20.
InnehållKatalastest
A. Applicera en droppe 3% väteperoxid på ett objektglas.
B. Överför bakterier med hjälp av en plastögla till H2O2 -lösningen.
C. En katalas positiv bakterie ger gasbildning (O2) i form av bubblor
D. En katalas negaitiv bakterie ger ingen gasbildning. Notera att det finns fragment av bakteriekolonier, men inga bubblor i lösningen.
- Klicka på bilden för att förstora den.
Många aeroba bakterier och de flesta som är fakultativt anaeroba producerar enzymet katalas, som ingår i bakteriernas enzymsystem för avgiftning av H2O2 (väteperoxid). H2O2 bildas från superoxidradikalen med hjälp av enzymet superoxiddismutas. Många syretoleranta bakterier har peroxidas (som inte är samma enzym som cytokrom c oxidas) i stället för katalas. Obligata anaerober saknar både superoxiddismutas och katalas.
Katalas innehåller en hemgrupp vid den aktiva ytan och följande reaktion katalyseras med ett mycket högt omsättningstal (turnover number):
2 H2O2 → 2 H2O + O2
Katalastestet används huvudsakligen för grampositiva bakterier och kan t.ex. utnyttjas för att skilja Staphylococcus spp. och Micrococcus spp., som är katalaspositiva från Streptococcus spp. respektive Enterococcus spp. som är katalasnegativa.
Uppdaterad: 2017-12-20.
InnehållAnvänds för att skilja Staphylococcus aureus från koagulasnegativa Staphylococcus spp. Observera dock att vissa stammar av S. aureus kan vara koagulasnegativa, men det är ovanligt. Vissa stammar av S. hyicus och S. intermedius kan vara koagulaspositva. S. pseudintermedius är koagulaspositiv, men först efter 24 tim.
Uppdaterad: 2013-10-01.
InnehållMånga bakterier har enzymer som kan bryta ner lipider, s.k. lipaser. Lecithinas, som även kallas fosfolipas C, är ett sådant enzym som spjälkar fosfolipiden lecithin (= t.ex. fosfatidylkolin). Fosfolipider, som är laddade är vanligen lösliga i vatten, men en av produkterna som bildas vid spjälkningen, nämligen en diglycerid, är oladdad och har två långa kolvätekedjor. Den är därför olöslig i vatten och detta utnyttjas i lecithinas-testet då man odlar bakterierna på äggule-agar. Äggula innehåller mycket lecithin.
Figure: Bacillus cereus på äggule-agar. Notera utfällningen runt bakteriestryket, som visar att den är positiv för lecithinas.
Kan bl.a. användas för att skilja på vissa arter inom genus Bacillus.
Uppdaterad: 2017-11-30.
InnehållOxidastest
A. Ett par droppar av oxidasreagenset appliceras på ett filtrerpapper.
B och C. Kolonimaterial överförs med hjälp av en plastögla till fläcken med reagenset på filtrerpappret.
C. Fläcken till vänster består av oxidaspositiva bakterier och den till höger av oxidasnegativa bakterier.
D. Slutresultat kan observeras efter 30 sek.
- Klicka på bilden för att förstora den.
Bakterier, som har aerob cellandning, har ofta cytokrom c och ett cytokrom c oxidas, vilket i kombination med andra metoder kan användas vid typning. Man använder ofta ett kommersiellt test, vilket innehåller en artificiell elektronacceptor (N, N, N', N'-tetrametyl-p-fenylendiamin, se Fig. 1), som ändrar färg beroende på redoxtillstånd. Substansen är en s.k. redoxindikator och den kan alltså oxideras av den oxiderade formen av cytokrom c. Cytokrom c oxidas är det sista enzymet i andningskedjan, där det normalt reducerar syre till vatten och pumpar ut protoner enligt följande nettoreaktion:
4 Fe2+-cytochrome cred + 8H+in + O2 → 4 Fe3+-cytochrome cox + 2H2O + 4H+out
Cytokrom c oxidas är ett transmembranproteinkomplex (Komplex IV), som också finns i mitokondriernas plasma- (inner-) membran.
Notera att oxidasreagenset inte är stabilt efter det att ampullen har öppnats. Det kan användas under någon timmes tid, men det oxideras så småningom av syret i luften.
Oxidas-testet används ofta för identifiering av gram-negativa bakterier. T.ex. för att identifiera medlemmar av familjen Enterobacteriaceae, som är oxidas-negativa, utom genus Plesiomonas (ox+). Medlemmar av familjen Pseudomonadaceae, samt genus Aeromonas och Campylobacter är oxidas-positiva.
Uppdaterad: 2017-12-20.
Innehåll
Figuren visar resultatet av ett ureastest, där rör A utgör negativ kontroll. Rör B innehåller, Proteus sp. och rör C innehåller Escherichia coli. Observera att ett pH-omslag har skett i rör B därför att Proteus spp. är ureaspositiva.
Bild: Karl-Erik Johansson (BVF, SLU) och Lise-Lotte Fernström (BVF, SLU).
Vissa bakterier har enzymet ureas, som i närvaro av H2O bryter ner urea (=urinämne eller karbamid) till NH3 (ammoniak) och CO2 (koldioxid), som bildar ammoniumkarbonat i närvaro av vatten. Se kemisk reaktionsformel.
Man kan testa om bakterien har ureas genom att odla dem i ureas-medium, som innehåller en pH-indikator. Om bakterien har ureas bildas ammoniumkarbonat och odlingsmediet blir basisk d.v.s. färgen slår om till röd (cerise) färg.
Ureas-buljong:
Substans | Mängd (g) |
---|---|
Pepton | 1,0 |
Glukos | 1,0 |
Natriumklorid | 5,0 |
Dinatriumfosfat | 1,2 |
Kaliumdivätefosfat | 0,8 |
Fenolrött | 0,004 |
Ureastestet kan bl.a. användas för att skilja E. coli, som är ureasnegativ, från Proteus spp., som är ureaspositiv.
Uppdaterad: 2017-03-31.
Innehåll2 pyruvate + NADH --> 2CO2 + 2,3-butanediol.
Om KOH (kaliumhydroxid) tillsättes, så omvandlas acetoin till diacetyl (= 2,3-butandion), som reagerar med alfa-naftol och bildar ett rosa komplex.Klebsiella spp. och Enterobacter spp. har
butandiolfermentation till skillnad från Escherichia coli, Salmonella spp. och Shigella spp.
Uppdaterad: 2012-12-11.
Innehåll